Odborné publikace

2024

1. Baka, M., Edr, A., Krupková, A., Šťastná Červenková, L., Bernásková, J., Greguš, V., Čermák, J., Strašák, T. Modular synthesis of dendritic ionic triphiles and their behavior in three-phase liquid-liquid-liquid system. Journal of Molecular Liquids, 2024, roč. 2024, č. 404, s. “nestrankovano”.
2. Dušková, T., Čermák, J., Cantore, M., Greguš, V., Sydow, J., Henych, J., Ferenz, K.B. Harnessing Perfluorocarbon-Based nanocarriers for Rhodium(III) NHC complex Delivery: Synthesis, Characterization, and cytotoxicity evaluation. Inorganica chimica acta, 2024, roč. 2024, č. 576, s. 1-9.
3. Ederer, J., Ryšánek, P., Vrtoch, Ľ., Neubertová, V., Henych, J., Životský, O., Janoš, P., Adamec, S., Kolská, Z. Magnetite/ceria-based composites for effective adsorption of pharmaceuticals and pesticides in water. Journal of Water Process Engineering, 2024, roč. 2024, č. 63, s. 105446-105458.
4. Harrandt, V., Bazaykin, Y., Huchet, F., Tihon, J., Havlica, J. Theoryfor electrodiffusional wall shear stress measurement by directionally sensitive twin semicircular probe. International Journal of Heat and Mass Transfer, 2024, roč. 2024, č. 235, s. “nestrankovano”.
5. Henych, J., Šťastný, M., Kříženecká, S., Čundrle, J., Tolasz, J., Dušková, T., Kormunda, M., Ederer, J., Stehlík, Š., Ryšánek, P., Neubertová, V., Janoš, P. Ceria-Catalyzed Hydrolytic Cleavage of Sulfonamides. Inorganic Chemistry, 2024, roč. 2024, č. 63, s. 2298-2309.
6. Univerzita Jana Evangelisty Purkyně v Ústí nad Labem. Nanokompozitní membrána pro sorpci vodíku. Hoskovec, J., Čapková, P., Gardeno, D., Friess, K., Šícha, V., Kaule, P., Greguš, V., Ryšánek, P., Škvorová, M., Dušková, T. D23109996. 14.12.2023.
7. Hoskovec, J., Čapková, P., Ryšánek, P., Gardeno, D., Friess, K., Jarolímková, J., Greguš, V., Kaule, P., Dušková, T., Škvorová, M., Šícha, V., Benada, O. A hydrogen adsorbing PUR/Pd nanocomposite nanofibrous membrane prepared by electrospinning technology. Journal of materials chemistry. A., 2024, roč. 2024, č. “necislovano”, s. “nestrankovano”.
8. Kocík, J., Tišler, Z., Hájek, M., Peroutková, K., Šimek, J., Strejcová, K., Malina, J. Epoxidation of methyl esters from waste vegetable oil by heterogeneous catalysts WO3/Al2O3. Molecular Catalysis, 2024, roč. 2024, č. 569, s. “nestrankovano”.
9. Nezbeda, I., Škvára, J. A remark on hard body fluids: density versus packing fraction and excluded volume. Molecular Physics, 2024, roč. 2024, č. “necislovano”, s. “nestrankovano”.
10. Panuška, P., Smejkal, J., Štofik, M., Aubrecht, P., Španbauerová, K., Havlica, J., Harrandt, V., Vinopal, S., Žmudová, Z., Malý, J. Advanced Microfluidic Platform for Tumor Spheroid Formation and Cultivation Fabricated from OSTE+ Polymer. BioChip Journal, 2024, roč. 2024, č. “necislovano”, s. “nestrankovano”.
11. Valencia-Galindo, M., Saez, E., Kozakovič, M., Havlica, J., Kramoliš, D., Chavez-Crooker, P. Analysis of the breakage of the bio-cementation generated on glass beadsduring a direct shear test using a DEM model. Computational Particle Mechanics, 2024, roč. 2024, č. “necislovano”, s. “nestrankovano”.

2023

[1] Dušková, T., Prajapati, D.S., Kaule, P., Červenková Šťastná, L., Strašák, T., Čermák, J. N-heterocyclic carbenes with three and six fluorous ponytails and their highly fluorophilic Rh and Ir complexes. Journal of Organometallic Chemistry, 2023, roč. 2023, č. 986, s. 1-9.

[2] Harrandt, V., Kramoliš, D., Huchet, F., Tihon, J., Havlica, J. The electrodiffusional theory for the wall shear stress measurement by two-strip probe. International Journal of Heat and Mass Transfer, 2023, roč. 2023, č. 212, s. “nestrankovano”.

[3] Hordiichuk, V., Škvára, J., Trokhymchuk, A., Nezbeda, I. Structure and thermodynamics of a short-range Lennard-Jones fluid reference. Journal of Molecular Liquids, 2023, roč. 2023, č. 386, s. “nestrankovano”.

[4] Chatzigeorgiou, S., Jilkova, J., Korecka, L., Janyskova, R., Hermannova, M., Simek, M., Cozikova, D., Slovakova, M., Bilkova, Z., Bobek, J., Cerny, Z., Cihak, M., Velebny, V. Preparation of hyaluronan oligosaccharides by a prokaryotic beta-glucuronidase: Characterization of free and immobilized forms of the enzyme. Carbohydrate Polymers, 2023, roč. 2023, č. 317, s. “nestrankovano”.

[5] Klajmon, M., Nezbeda, I. Assessing the quality of SAFT equations for the vapor–liquid equilibrium of pure water. Journal of Molecular Liquids, 2023, roč. 2023, č. 376, s. “nestrankovano”.

[6] Kozakovič, M., Havlica, J., Le Guen, L., Pařez, S., Huchet, F. Recognition of the granular airborne portion in a flighted rotary drum. Powder Technology, 2023, roč. 2023, č. 425, s. “nestrankovano”.

[7] Nguyen Thi, T.H., Koutecká, J., Kaule, P., Vrtoch, Ľ., Šícha, V., Čermák, J. Design and Synthesis of New Sulfonic Acid Functionalized Ionic Liquids as Catalysts for Esterification of Fatty Acids with Bioethanol. Molecules, 2023, roč. 28, č. 13, s. “nestrankovano”.

[8] Novotná Floriančičová, K., Baltzis, A., Smejkal, J., Czerneková, M., Kaczmarek, Ł., Malý, J., Notredame, C., Vinopal, S. Phylogenetic and functional characterization of water bears (Tardigrada) tubulins. Scientific Reports, 2023, roč. 13, č. 1, s. “nestrankovano”.

[9] Pařez, S., Kozakovič, M., Havlica, J. Pore Pressure Drop During Dynamic Rupture and Conditions for Dilatancy Hardening. Journal of Geophysical Research: Solid Earth, 2023, roč. 128, č. 7, s. “nestrankovano”.

[10] Pasichnyk, M., Stanovsky, P., Polezhaev, P., Zach, B., Šyc, M., Bobák, M., Jansen, J.C., Pribyl, M., Bara, J.E., Friess, K., Havlica, J., Gin, D.L., Noble, R.D., Izak, P. Membrane technology for challenging separations: Removal of CO2, SO2 and NOx from flue and waste gases. Separation and Purification Technology, 2023, roč. 2023, č. 323, s. “nestrankovano”.

[11] Škvára, J., Nezbeda, I., Urbic, T. Supercooled water in two dimensions: Structure and thermodynamics of the Mercedes-Benz model. Journal of Molecular Liquids, 2023, roč. 2023, č. 386, s. “nestrankovano”.

2022

[1]Bobek, J., Filipová, E., Bergman, N., Čihák, M., Petříček, M., Lara, A.C., Kristufek, V., Megyes, M., Wurzer, T., Chroňáková, A., Petříčková, K. Polyenic Antibiotics and Other Antifungal Compounds Produced by Hemolytic Streptomyces Species. International Journal of Molecular Sciences, 2022, roč. 23, č. 23, s. 1-22.

[2]Hoskovec, J., Čapková, P., Vostiňáková, M., Ryšánek, P., Kaule, P., Tokarský, J., Benada, O., Blechta, V. Permeable membranes PUR/TETA and PUR/TEPA for CO2 capture prepared by one-step electrospinning technology. Fibers, 2022, roč. 10, č. 11, s. “nestrankovano”.

[3]Jančaříková, K., Brůnová, L., Hejnová, E., Hlaváčová, L., Jančařík, A., Králík, J., Krátká, M., Krejčí, J., Kroufek, R., Matějček, T., Medová, J., Pelikánová, M., Svobodová, S., Šmídl, M., Trahorsch, P., Vojíř, K. Didaktické zásady v přírodovědném vzdělávání: metodická příručka pro učitele biologie, chemie, fyziky, geografie, informatiky, matematiky a lektory environmentální výchovy. Praha : Univerzita Karlova, Pedagogická fakulta, 2022. 157 s. “neuveden”.
ISBN: 978-80-7603-289-7.

[4]Kozakovič, M., Havlica, J., Huchet, F. Matematické modelování transportu tepla a hmoty v rotační peci. In Sborník abstraktů. Ústí nad Labem : Fakulta strojního inženýrství UJEP, 2022, s. 6.

[5]Kozakovič, M., Cada, J., Kokavcova, A., Havlica, J., Huchet, F. Mathematical Modeling of Heat and Mass Transfer in a Rotary Kiln. In Proceedings of the 9th International Conference on Chemical Technology. Praha : Czech Society of Industrial Chemistry, 2022, s. 6.

[6]Krátký, M., Novotná, E., Stolaříková, J., Švarcová, M., Vinšová, J. Substituted N-phenylitaconamides as inhibitors of mycobacteria and mycobacterial isocitrate lyase. European Journal of Pharmaceutical Sciences, 2022, roč. 2022, č. 176, s. 1-8.

[7] Majerová, V.., Smejkal, J.., Novotná Floriančičová, K.., Vinopal, S.., Czerneková, M.. Development of a novel desiccation chamber for induction of tardigrade anhydrobiosis. Kostelec nad Černými Lesy : ČESKÁ ZEMĚDĚLSKÁ UNIVERZITA V PRAZE FAKULTA ŽIVOTNÍHO PROSTŘEDÍ, 2022.

[8] Majerová, V.., Smejkal, J.., Novotná Floriančičová, K.., Vinopal, S.., Czerneková, M.. Development of a novel desiccation chamber for induction of tardigrade anhydrobiosis. Krakow : 15th international Symposium on Tardigrada, 2022.

[9]Nezbeda, I. On a molecular origin of properties of water. Journal of Molecular Liquids, 2022, roč. 2022, č. 365, s. “nestrankovano”.

[10]Nezbeda, I. On a flaw in the development of simple(primitive)-model-based equations of state for water. Chemical Physics Letters, 2022, roč. 2022, č. 790, s. “nestrankovano”.

[11]Nezbeda, I., Klajmon, M., Hrubý, J. Thermodynamic properties of water from SAFT and CPA equations of state: A comprehensive assessment. Journal of Molecular Liquids, 2022, roč. 2022, č. 362, s. “nestrankovano”.

[12]Novotná Floriančičová, K., Baltzis, A., Smejkal, J., Czerneková, M., Notredame, C., Vinopal, S. Characterization of tardigrade tubulins. Vranovská Ves, MBÚ AV ČR, 14.09.2022 – 16.09.2022.

[13] Novotná Floriančičová, K.., Baltzis, A.., Smejkal, J.., Czerneková, M.., Notredame, C.., Vinopal, S.. Characterization of tardigrade tubulins. Krakow : 15th International Symposium on Tardigrada, 2022.

[14] Novotná Floriančičová, K.., Baltzis, A.., Smejkal, J.., Czerneková, M.., Notredame, C.., Vinopal, S.. Characterization of tardigrade tubulins. Kostelec nad Černými Lesy : ČESKÁ ZEMĚDĚLSKÁ UNIVERZITA V PRAZE, FAKULTA ŽIVOTNÍHO PROSTŘEDÍ, 2022.

[15]Pflégr, V., Štěpánková, Š., Svrčková, K., Švarcová, M., Vinšová, J., Krátký, M. 5-Aryl-1,3,4-oxadiazol-2-amines Decorated with Long Alkyl and Their Analogues: Synthesis, Acetyl- and Butyrylcholinesterase Inhibition and Docking Study. Pharmaceuticals, 2022, roč. 15, č. 4, s. “nestrankovano”.

[16]Škvára, J., Nezbeda, I. Thermodynamics and structure of supercooled water. II.. Journal of Molecular Liquids, 2022, roč. 2022, č. 367, s. nestránkováno.

[17]Šmídl, M., Špitálská, T., Šícha, V. Vznik dendritických krystalů kovů ve vodných roztocích účinkem stejnosměrného elektrického proudu. Biologie. Chemie. Zeměpis, 2022, roč. 21, č. 1, s. 41-46.

[18]Vaňková, E., Lokočová, K., Kašparová, P., Hadravová, R., Křížová, I., Maťátková, O., Masák, J., Šícha, V. Cobalt Bis-Dicarbollide Enhances Antibiotics Action towards Staphylococcus epidermidis Planktonic Growth Due to Cell Envelopes Disruption. Pharmaceuticals, 2022, roč. 15, č. 5, s. 534-548.

[19] Panuška, P.., Smejkal, J.., Štofik, M.., Havlica, J.., Harrandt, V.., Vinopal, S.., Aubrecht, P.., Malý, J.., Žmudová, Z.., Španbauerová, K.. Kapičkový mikrofluidní systém pro vytvoření a kultivaci 3D buněčných shluků. Přírodovědecká fakulta UJEP, 2022.

2021

[1]Bobek, J.Mikulová, A.Šetinová, D.Elliot, M.Čihák, M. 6S-Like scr3559 RNA Affects Development and Antibiotic Production in Streptomyces coelicolor. Microorganisms, 2021, roč. 9, č. 10, s. “nestrankovano”.

[2]Dědičová, Š.Dočkal, J.Moučka, F.Jirsák, J. Molecular dynamics simulation study of the effect of a strong electric field on the structure of a poly(oxyethylene) chain in explicit solvents. Journal of Molecular Liquids, 2021, roč. 2021, č. 338, s. “nestrankovano”.

[3]Havlica, J.Kozakovič, M.Kramoliš, D.Trávníčková, T.Kohout, M. The effect of primary and secondary flows on the homogenization process in a vertical bladed mixer. Powder Technology, 2021, roč. 2021, č. 391, s. 253-266.

[4]Havlica, J.Kramoliš, D.Huchet, F. A revisit of the electro-diffusional theory for the wall shear stress measurement. International Journal of Heat and Mass Transfer, 2021, roč. 2021, č. 165, s. “nestrankovano”.

[5]Jirsáková, K.Stanovský, P.Dytrych, P.Morávková, L.Přibylová, K.Petrusová, Z.Jansen, J.C.Izák, P. Organic vapour permeation in amorphous and semi-crystalline rubbery membranes: Experimental data versus prediction by solubility parameters. Journal of Membrane Science, 2021, roč. 2021, č. 627, s. “nestrankovano”.

[6]Kalyuzhnyi, Y.V.Nezbeda, I.Cummings, P.T. Integral equation theory for mixtures of spherical and patchy colloids. 2. Numerical results. Soft Matter, 2021, roč. 17, č. 12, s. 3513-3519.

[7]Krátký, M.Štěpánková, Š.Konečná, K.Svrčková, K.Maixnerová, J.Švarcová, M.Janďourek, O.Trejtnar, F.Vinšová, J. Novel Aminoguanidine Hydrazone Analogues: From Potential Antimicrobial Agents to Potent Cholinesterase Inhibitors. Pharmaceuticals, 2021, roč. 14, č. 12, s. “nestrankovano”.

[8]Krupková, A.Kubátová, K.Červenková Šťastná, L.Cuřínová, P.Müllerová, M.Karban, J.Čermák, J.Strašák, T. Poly(imidazolium) Carbosilane Dendrimers: Synthesis, Catalytic Activity in Redox Esterification of ?,??Unsaturated Aldehydes and Recycling via Organic Solvent Nanofiltration. Catalysts, 2021, roč. 11, č. 11, s. “nestrankovano”.

[9]Nejedlá, Z.Poustka, D.Herma, R.Liegertová, M.Štofik, M.Smejkal, J.Šícha, V.Kaule, P.Malý, J. Class II biocompatible E-Shell 300 3D printing material causes severe developmental toxicity in Danio rerio embryos and reduced cell proliferation in vitro ? implications for 3D printed microfluidics. RSC Advances, 2021, roč. 11, č. 27, s. 16252-16267.

[10]Nezbeda, I. Structure of Simple Dipolar Water-Like Fluids: Primitive Model and Hard Tetrahedra. Frontiers in chemistry, 2021, roč. 2021, č. 9, s. “nestrankovano”.

[11]Nezbeda, I.Škvára, J. On industrial applications of molecular simulations. Molecular Simulation, 2021, roč. 2021, č. 47, s. 846-856.

[12]Nezbeda, I. Thermodynamic perturbation theory and equation of state developments. Condensed Matter Physics, 2021, roč. 2021, č. 24, s. 1-6.

[13]Novotná Floriančičová, K.Baltzis, A.Czerneková, M.Smejkal, J.Notredame, C.Vinopal, S. Phylogenetic analysis of tardigrade tubulins. Vranovská Ves, Organized by the Laboratory of Molecular Genetics of Development, and the Lánský/Braun Lab, 12.11.2021 – 13.11.2021.

[14]Novotná Floriančičová, K.Baltzis, A.Czerneková, M.Smejkal, J.Notredame, C.Vinopal, S. Phylogenetic analysis of tardigrade tubulins. Kostelec nad Černými lesy, Katedra ekologie, Fakulta životního prostředí, Česká zemědělská univerzita v Praze, Kamýcká 129, 165 00 Praha 6 ? Suchdol, 18.11.2021 – 19.11.2021.

[15]Panuška, P.Nejedlá, Z.Smejkal, J.Aubrecht, P.Liegertová, M.Štofik, M.Havlica, J.Malý, J. A millifluidic chip for cultivation of fish embryos and toxicity testing fabricated by 3D printing technology. RSC Advances, 2021, roč. 11, č. 33, s. 20507-20518.

[16]Trávníčková, T.Havlica, J.Kozakovič, M.Hrubý, J.Ždímal, V. Derivation and validation of a simplified analytical mass transfer model of the laminar co-flow tube for nucleation studies. International Journal of Heat and Mass Transfer, 2021, roč. 2021, č. 179, s. 1-14.

2020

[1]Červenková Šťastná, L.., Bílková, V.., Cézová, T.., Cuřínová, P.., Karban, J.., Čermák, J.., Krupková, A.., Strašák, T.. Imidazolium Based Fluorous N-Heterocyclic Carbenes as Effective and Recyclable Organocatalysts for Redox Esterification. European journal of organic chemistry, 2020, roč. 2020, č. 24, s. 3591-3598.

[2]Gaálová, J.., Yalcinkaya, F.., Cuřínová, P.., Kohout, M.., Yalcinkaya, B.., Koštejn, M.., Jirsák, J.., Stibor, I.., Bara, J.E.., Van der Bruggen, B.., Izák, P.. Separation of racemic compound by nanofibrous composite membranes with chiral selector. Journal of Membrane Science, 2020, roč. 2020, č. 596, s. “nestrankovano”.

[3]Havlica, J.., Kramoliš, D.., Huchet, F.. A revisit of the electro-diffusional theory for the wall shear stress measurement. International Journal of Heat and Mass Transfer, 2020, roč. 2021, č. 165, s. “nestrankovano”.

[4]Herbrík, A.., Corretto, E.., Chroňáková, A.., Langhansová, H.., Petrásková, P.., Hrdý, J.., Čihák, M.., Krištůfek, V.., Bobek, J.., Petříček, M.., Petříčková, K.. A Human Lung-Associated Streptomyces sp.TR1341 Produces Various Secondary Metabolites Responsible forVirulence, Cytotoxicity and Modulation of Immune Response. Frontiers in Microbiology, 2020, roč. 2020, č. 10, s. “nestrankovano”.

[5]Jirsák, J.., Pokorný, P.., Holec, P.., Dědičová, Š.. A Molecular-Level Picture of Electrospinning. Water, 2020, roč. 12, č. 9, s. 2577-1 – 2577-31.

[6]Kalyuzhnyi, Y.V.., Nezbeda, I.., Cummings, P.T.. Integral equation theory for a mixture of spherical and patchy colloids: analytical description. Soft Matter, 2020, roč. 16, č. 14, s. 3456-3465.

[7]Krátký, M.., Baranyai, Z.., Štěpánková, Š.., Svrčková, K.., Švarcová, M.., Stolaříková, J.., Horváth, L.., Bösze, S.., Vinšová, J.. N-Alkyl-2-[4-(trifluoromethyl)benzoyl]hydrazine- 1-carboxamides and Their Analogues: Synthesis and Multitarget Biological Activity. Molecules, 2020, roč. 25, č. 10, s. “nestrankovano”.

[8]Krátký, M.., Štěpánková, Š.., Brablíková, M.., Svrčková, K.., Švarcová, M.., Vinšová, J.. Novel Iodinated Hydrazide-hydrazones and their Analogues as Acetyl- and Butyrylcholinesterase Inhibitors. Current Topics in Medicinal Chemistry, 2020, roč. 20, č. 23, s. 2106-2117.

[9]Nezbeda, I.. On Molecular-Based Equations of State: Perturbation Theories, Simple Models, and SAFT Modeling. Frontiers in physics, 2020, roč. 2020, č. 8, s. “nestrankovano”.

[10]Nezbeda, I.., Škvára, J.. On industrial applications of molecular simulations. Molecular Simulation, 2020, roč. 2020, č. “nečíslováno”, s. “nestrankovano”.

[11]Otmar, M.., Gaálová, J.., Žitka, J.., Brožová, L.., Cuřínová, P.., Kohout, M.., Hovorka, Š.., Bara, J.E.., Van der Bruggen, B.., Jirsák, J.., Izák, P.. Preparation of PSEBS membranes bearing (S)-(MINUS SIGN )-methylbenzylamine as chiral selector. European Polymer Journal, 2020, roč. 2020, č. 122, s. “nestrankovano”.

2019

[1]Havlica, J.., Caisová, K.., Trávníčková, T.., Stanovsky, P.., Petrus, P.., Kohout, M.. Granular dynamics in a vertical bladed mixer: Secondary flow patterns. Powder Technology, 2019, roč. 2019, č. 344, s. 79-88.

[2]Kalyuzhnyy, Y.., Škvára, J.., Nezbeda, I.. Analytic results for the three- and four-particle correlation functions of the fluid of hard disks. Journal of Chemical Physics, 2019, roč. 150, č. 3, s. “034502-1”-“034502-7”.

[3]Kozakovič, M.., Kramoliš, D.., Trávníčková, T.., Stanovský, P.., Kohout, M.., Havlica, J.. Granular Vertical Bladed Mixer: Flow Patterns and Homogenization. In Book of Abstracts. Florence : Italian Association of Chemical Engineering, 2019, s. 2.

[4]Kozakovič, M.., Paříková, A.., Trávníčková, T.., Kohout, M.., Havlica, J.. The Effect of Collision Parameters and Particle Diameter on Dynamics and Mixing Process of Granular Material by using Discrete Element Method. In International Congress of Chemical and Process Engineering CHISA 2018. Praha : Czech Society of Chemical Engineering, 2019, s. 2.

[5]Kozakovič, M.., Kramoliš, D.., Trávníčková, T.., Kohout, M.., Havlica, J.. Vliv koeficientu tření na proces homogenizace granulárního materiálu v cylindrickém mixeru se dvěma zkosenými lopatkami. In Sborník příspěvků EVM 2019. Ústí nad Labem : Fakulta strojního inženýrství UJEP, 2019, s. 10.

[6]Nezbeda, I.. Vapour-liquid equilibria from molecular simulations: some issues affecting reliability and reproducibility. Molecular Physics, 2019, roč. 117, č. 20, s. 2814-2821.

[7]Nezbeda, I.., Moučka, F.. Thermodynamics of supersaturated steam: Towards an equation of state. Fluid Phase Equilibria, 2019, roč. 2019, č. 484, s. 114-121.

[8]Rychtera, J.., Šmídl, M.., Bílek, M.. Jak eliminovat kritická místa počátečního chemického vzdělávání – příklady témat “Složení roztoků” a “Názvosloví solí”. Arnica, 2019, roč. 9, č. 1, s. 31-38.

[9]Šícha, V.., , , , , , , , 2019,

[10]Škrabalová, L.., Trávníčková, T.., Havlica, J.., Krejčí, P.., Hrubý, J.., Ždímal, V.. Novel Approach In Binary Nucleation Experiments Performed Under Laboratory Conditions. In Proceedings of the 20th International Conference on Nucleation and Atmospheric Aerosols. Helsinki : Kirjapaino Hermes Oy, 2019, s. 2.

[11]Škvára, J.., Nezbeda, I.. Surface of aqueous solutions of alkali halides: layer by layer analysis. Molecular Simulation, 2019, roč. 45, č. 4-5, s. 358-372.

[12]Šmídl, M.., Dupalová, A.., Jankuj, M.. Přírodopis s nadhledem 9 – Nová generace (pracovní sešit pro základní školy a víceletá gymnázia). Plzeň : Nakladatelství FRAUS, 2019. 64 s. 1..
ISBN: 978-80-7489-483-1.

[13] Štofik, M…, Havlica, J…, Malý, J… Mikrofluidní zařízení pro filtraci buněk s možností optické kontroly průběhu filtrace. Přírodovědecká fakulta UJEP, 2019.

[14]Trávníčková, T.., Havlica, J.., Hrubý, J.., Ždímal, V.. Modelování binární nukleace v laminární souproudé difúzní komoře. In Book of Abstracts. Praha : Czech Society of Chemical Engineering, 2019, s. 2.

[15]Trávníčková, T.., Havlica, J.., Hrubý, J.., Ždímal, V.. Modelling of Binary Nucleation in Laminar Co-Flow Tube. In Book of Abstracts. Florence : Italian Association of Chemical Engineering, 2019, s. 2.

[16]Trávníčková, T.., Havlica, J.., Hrubý, J.., Ždímal, V.. Nucleation of H2SO4-H2O in Laminar co-Flow Tube: CFD Simulations and Analytical Modelling. In International Congress of Chemical and Process Engineering CHISA 2018. Praha : Czech Society of Chemical Engineering, 2019, s. 2.

[17]Trávníčková, T.., Havlica, J.., Hrubý, J.., Ždímal, V.. Modelling of Binary Nucleation in Laminar Co – Flow Tube. In Sborník XX. výroční konference České aerosolové společnosti, pp.. Praha : Česká aerosolová společnost, 2019, s. 2.

[18]Vaňková, E.., Lokočová, K.., Maťátková, O.., Křížová, I.., Masák, J.., Grüner, B.., Kaule, P.., Čermák, J.., Šícha, V.. Cobalt bis-dicarbollide and its ammonium derivatives are effective antimicrobial and antibiofilm agents. Journal of Organometallic Chemistry, 2019, roč. 2019, č. 899, s. 120891-120898.

2018

[1]Babichev, S., Škvor, J., Fišer, J., Lytvynenko, V. Model of the Objective Clustering Inductive Technology of Gene Expression Profiles Based on SOTA and DBSCAN Clustering Algorithms. In Advances in Intelligent Systems and Computing. Springer International Publishing : Springer, Cham, 2018, s. 19.

[2]Barczi, T., Kohout, M., Kozakovič, M., Havlica, J., Ratnayake, C. Discrete Element Method Simulation and Experimental Validation of Pattern Development in a Rotating Drum Mixer. Chemical Engineering & Technology, 2018, roč. 41, č. 8, s. 1524-1530.

[3]Kalyuzhnyy, Y., Vlachy, V. Modeling the depletion effect caused by an addition of polymer to monoclonal antibody solutions. Journal of Physics-Condensed Matter, 2018, roč. 30, č. 48, s. “nestrankovano”.

[4]Liegertová, M., Wróbel, D., Dostálová, R., Müllerová, M., Červenková Šťastná, L., Cuřínová, P., Strašák, T., Malý, M., Čermák, J., Smejkal, J., Štofik, M., Malý, J. Evaluation of toxicological and teratogenic effects of carbosilane glucose glycodendrimers in zebrafish embryos and model rodent cell lines.. Nanotoxicology, 2018, roč. 12, č. 8, s. 797-818.

[5]Moučka, F., Kolafa, J., Lísal, M., Smith, W.R. Chemical potentials of alkaline earth metal halide aqueous electrolytes and solubility of their hydrates by molecular simulation: Application to CaCl2, antarcticite and sinjarite. Journal of Chemical Physics, 2018, roč. 148, č. 22, s. 222832-1 — 222832-12.

[6]Rouha, M., Nezbeda, I., Hrubý, J., Moučka, F. Higher virial coefficients of water. Journal of Molecular Liquids, 2018, roč. 2018, č. 270, s. 81-86.

[7]Rychtera, J., Bílek,, M., Bártová, I., Chroustová, K., Sloup, R., Šmídl, M., Machková, V., Štrofová, J., Kolář, K., Kesnerová Řádková, O. Která jsou klíčová, kritická a dynamická místa počáteční výuky chemie v České republice?. Arnica, 2018, roč. 8, č. 1, s. 35-44.

[8]Smith, W.R., Nezbeda, I., Kolafa, J., Moučka, F. Recent progress in the molecular simulation of thermodynamic properties of aqueous electrolyte solutions. Fluid Phase Equilibria, 2018, roč. 2018, č. 466, s. 19-30.

[9]Svoboda, M., Moučka, F., Lísal, M. Saturated aqueous NaCl solution and pure water in Na-montmorillonite clay at thermodynamic conditions of hydraulic fracturing: Thermodynamics, structure and diffusion from molecular simulations. Journal of Molecular Liquids, 2018, roč. 271, s. 490-500.

[10]Šetinová, D., Šmídová, K., Pohl, P., Musić, I., Bobek, J. RNase III-Binding-mRNAs Revealed Novel Complementary Transcripts in Streptomyces. Frontiers in Microbiology, 2018, roč. 2018, č. 8,

[11]Škoda, J., Doulík, P., Šmídl, M. Chemie 9 – Nová generace (příručka učitele). Plzeň : Fraus, 2018. 192 s. 1.
ISBN: 978-80-7489-402-2.

[12]Škoda, J., Doulík, P., Šmídl, M. Chemie 8 – Nová generace (příručka učitele). 1. vyd. Plzeň : Fraus, 2018. 216 s. 1.
ISBN: 978-80-7489-398-8.

[13]Škvára, J., Škvor, J., Nezbeda, I. Evaluation of the contact angle from molecular simulations. Molecular Simulation, 2018, roč. 2018, č. 44, s. 190-199.

[14]Škvára, J., Moučka, F., Nezbeda, I. Structure of supercooled water: Polarizable BK3 model versus non-polarizable models. Journal of Molecular Liquids, 2018, roč. 2018, č. 261, s. 303-318.

[15]Škvára, J., Nezbeda, I. Molecular dynamics study of racemic mixtures: Solutions of ibuprofen and ?-cyclodextrin in methanol. Journal of Molecular Liquids, 2018, roč. 2018, č. 265, s. 791-796.

[16]Šmídl, M., Pelikánová, I. Chemie 9 – Nová generace (pracovní sešit). 1. vyd. Plzeň : Fraus, 2018. 68 s. 1.
ISBN: 978-80-7489-401-5.

[17]Šmídl, M., Pelikánová, I. Chemie 8 – Nová generace (pracovní sešit). 1. vyd. Plzeň : Fraus, 2018. 68 s. 1.
ISBN: 978-80-7489-397-1.

[18]Šmídová, K., Zikova, A., Pospíšil, J., Schwarz, M., Bobek, J., Vohradský, J. DNA mapping and kinetic modeling of the HrdB regulon in Streptomyces coelicolor. Nucleic Acids Research, 2018,

[19] TRÁVNÍČKOVÁ, Tereza, Lenka ŠKRABALOVÁ, Jaromir HAVLICA, Petr KREJČÍ, Jan HRUBÝ a Vladimír ŽDÍMAL. Laboratory study of H 2 SO 4 /H 2 O nucleation using a new technique – a laminar co-flow tube. Tellus B: Chemical and Physical Meteorology [online]. 2018, 70(1), 1-11.

2017

[1]Bobek, J., Smidova, K., Cihak, M. A Waking Review: Old and Novel Insights into the Spore Germination in Streptomyces. Frontiers in Microbiology, 2017, roč. 2017, č. 8, s. “nestrankovano”.

[2]Cihak, M., Kamenik, Z., Smidova, K., Bergman, N., Benada, O., Kofronova, O., Petrickova, K., Bobek, J. Secondary Metabolites Produced during the Germination of Streptomyces coelicolor. Frontiers in Microbiology, 2017, roč. 2017, č. 8, s. “nestrankovano”.

[3]Kakosová, E., Hrabák, P., Černík, M., Novotný, V., Czinnerová, M., Trögl, J., Popelka, J., Kuráň, P., Zoubková, L., Vrtoch, Ľ. Effect of various chemical oxidation agents on soil microbial communities. Chemical Engineering Journal, 2017, roč. 2017, č. 314, s. 257-265.

[4]Kuráň, P., Pilnaj, D., Ciencialová, L., Pšenička, M. Preparation of magnetic sorbent with surface modified by C18 for removal of selected organic pollutants from aqueous samples. IOP Conference Series: Materials Science and Engineering, 2017, roč. 2017, č. 95, s. 1-5.

[5]Kvasničková, E., Masák, J., Čejka, J., Maťátková, O., Šícha, V. Preparation, characterization, and the selective antimicrobial activity of N-alkylammonium 8-diethyleneglycol cobalt bis-dicarbollide derivatives. Journal of Organometallic Chemistry, 2017, roč. 2017, č. 827, s. 23-31.

[6]Moučka, F., Svoboda, M., Lísal, M. Modelling aqueous solubility of sodium chloride in clays at thermodynamic conditions of hydraulic fracturing by molecular simulations. Physical Chemistry Chemical Physics, 2017, roč. 2017, č. 19, s. 16586-16599.

[7]Rouha, M., Nezbeda, I. Second virial coefficients: a route to combining rules?. Molecular Physics, 2017, roč. 2017, č. 115, s. 1191-1199.

[8]Smith, W.R., Jirsák, J., Nezbeda, I., Qi, W. Molecular simulation of caloric properties of fluids modelled by force fields with intramolecular contributions: Application to heat capacities. Journal of Chemical Physics, 2017, roč. 147, č. 3, s. “034508-1” – “034508-12”.

[9]Strašák, T., Malý, J., Wróbel, D., Malý, M., Herma, R., Čermák, J., Müllerová, M., Šťastná, L.Č., Cuřínova, P. Phosphonium carbosilane dendrimers for biomedical applications – synthesis, characterization and cytotoxicity evaluation. RSC Advances, 2017, roč. 2017, č. 7, s. 18724-18744.

[10]Škvor, J., Škvára, J., Jirsák, J., Nezbeda, I. A general method for determining molecular interfaces and layers. Journal of Molecular Graphics and Modelling, 2017, roč. 2017, č. 76, s. 17-35.

[11] Trokhymchuk, A., Melnyk, R., Holovko, M., Nezbeda, I. Role of the reference system in study of fluid criticality by effective LGW Hamiltonian approach. Journal of Molecular Liquids, 2017, roč. 2017, č. 228, s. 194-200.

2016

[1]Ciencialová, L., Kozakovič, M., Jirounková, K., Kohout, M., Havlica, J. The Effect of Dynamics on the Homogenization via Discrete Element Method (DEM). In Sborník abstrakt a plných textů. Prague : Czech Society of Industrial Chemistry, 2016, 2016, s. 1.

[2]Čapková, P., Matoušek, J., Rejnek, J., Bendlová, N., Pavlík, J., Kormunda, M., Pilařová, V., Hocelíková, L. Effect of plasma treatment on structure and surface properties of montmorillonite. Applied Clay Science, 2016, roč. 2016, č. 129, s. 15-19.

[3]Čermák, J., Červenková Šťastná, L., Strašák, T. Cyclopentadienes and Cyclopentadienyl Complexes with Per- and Polyfluoroalkyl Substituents. In Advances in Chemistry Research. New York : Nova Science Publishers, Inc., 2016, s. 87-122.

[4] Dohnal, V.. Poskytnutí znalostí firmě Inpeko spol. s.r.o. v rámci Inovačního voucheru ÚK. Ústí nad Labem : Inpeko, spol. s.r.o., 2016.

[5]Ederer, J., Janoš, P., Ecorchard, P., Štengl, V., Bělčická, Z., Šťastný, M., Pop-Georgievski, O., Dohnal, V. Quantitative determination of acidic groups in functionalized graphene by direct titration. Reactive and functional polymers, 2016, roč. 2016, č. 103, s. 44-53.

[6]Havlica, J., Jirounková, K., Petrus, P., Trávníčková, T., Kohout, M. The Effect of Rotational Speed on Granular Dynamics and Homogenization in a Vertical Bladed Mixer. In Proceedings of the 7th International Conference on Discrete Elements Methods. Singapore : Springer Science+Business Media, 2016, s. 9.

[7]Hromadová, M., Kolivoška, V., Sokolová, R., Kocábová, J., Loukou, C., Mallet, J. Formation and investigation of 6-cysteinyl amino methylated beta-cyclodextrin self-assembled monolayers. Monatshefte fur Chemie, 2016, roč. 2016, č. 147, s. 45-51.

[8]Jirsák, J., Moučka, F., Nezbeda, I. Molecular simulation of electrospinning. In NANOCON 2015: 7TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON NANOMATERIALS – RESEARCH & APPLICATION. Ostrava : TANGER LTD, KELTICKOVA 62, SLEZSKA, OSTRAVA 710 00, CZECH REPUBLIC, 2016, s. 6.

[9]Kozakovič, M., Ciencialová, L., Jirounková, K., Kohout, M., Havlica, J. The Effect of Coefficient of Friction on Granular Mixing by Using Discrete Element Method (DEM). In Sborník abstrakt a plných textů. Prague : Czech Society of Industrial Chemistry, 2016, 2016, s. 1.

[10]Mašková, L., Smolík, J., Trávníčková, T., Havlica, J., Ondráčková, L., Ondráček, J. Contribution of Visitors to the Indoor PM in the National Library in Prague, Czech Republic. Aerosol and Air Quality Research, 2016, roč. 2016, č. 16, s. 1713-1721.

[11]Melnyk, R., Nezbeda, I., Trokhymchuk, A. Structure factor of a hard-core fluid with short-range Yukawa attraction: analytical FMSA theory against Monte Carlo simulations. Molecular Physics, 2016, roč. 2016, č. 114, s. 2523-2529.

[12]Moučka, F., Nezbeda, I. Thermodynamics of supersaturated steam: Molecular simulation results. Journal of Chemical Physics, 2016, roč. 2016, č. 145, s. 244501/1-244501/8.

[13]Nezbeda, I., Moučka, F., Smith, W.R. Recent progress in molecular simulation of aqueous electrolytes: Force fields, chemical potentials and solubility. Molecular Physics, 2016, roč. 2016, č. 114, s. 1665-1690.

[14]Nezbeda, I., Jirsák, J., Moučka, F. Molecular modeling and simulations. In Electrospun Nanofibers. Oxford : Elsevier Sci. Ltd., 2016, s. 255-275.

[15]Nezbeda, I. Simulations of Vapor-Liquid Equilibria: Routine versus Thoroughness. Journal of Chemical and Engineering Data, 2016, roč. 2016, č. 61, s. 3964-3969.

[16]Smith, W.R., Moučka, F., Nezbeda, I. Osmotic pressure of aqueous electrolyte solutions via molecular simulations of chemical potentials: Application to NaCl. Fluid Phase Equilibria, 2016, roč. 2016, č. 407, s. 76-83.

[17]Strašák, T., Malý, M., Müllerová, M., Čermák, J., Kormunda, M., Čapková, P., Matoušek, J., Šťastná Červenková, L., Rejnek, J., Holubová, J., Jandová, V., Čépe, K. Synthesis and characterization of carbosilane dendrimer–sodium montmorillonite clay nanocomposites. Experimental and theoretical studies. RSC Advances, 2016, roč. 2016, č. 6, s. 43356-43366.

2015

[1]Barczi, T., Trávníčková, T., Havlica, J., Kohout, M. Effect of Bed Depth on Granular Flow and Homogenization in a Vertical Bladed Mixer via Discrete Element Method. Chemical Engineering & Technology, 2015, roč. 38, č. 7, s. 1195-1202.

[2]Dohnalová, L., Dohnal, V. Nanočástice a jejich toxicita. Chemické listy, 2015, roč. 109, č. 6, s. 444-450.

[3]Hadač, O., Kohout, M., Havlica, J., Schreiber, I. Oscillations and patterns in a model of simultaneous CO and C2H2 oxidation and NOx reduction in a cross-flow reactor. Physical Chemistry Chemical Physics, 2015, roč. 17, č. 9, s. 6458-6469.

[4]Havlica, J., Jirounková, K., Trávníčková, T., Kohout, M. The effect of rotational speed on granular flow in a vertical bladed mixer. Powder Technology, 2015, roč. 280, č. August 01, 2015, s. 180-190.

[5]Chialvo, AA., Moučka, F., Vlček, L., Nezbeda, I. Vapor-liquid equilibrium and polarization behavior of the GCP water model: Gaussian charge-on-spring versus dipole self-consistent field approaches to induced polarization. Journal of physical chemistry. B, Condensed matter, materials, surfaces, interfaces and biophysical, 2015, roč. 119, č. 15, s. 55010-5019.

[6]Jirsák, J., Škvor, J. A molecular-based approach to termodynamics of aqueous solutions: Binary mixture of water and carbon dioxide. Journal of Physics-Condensed Matter, 2015, roč. 27, č. 19, s. 19411-4.

[7]Jirsák, J., Moučka, F., Škvor, J., Nezbeda, I. Aqueous electrolyte surfaces in strong electric fields: molecular insight into nanoscale jets and bridges. Molecular Physics, 2015, roč. 113, č. 8, s. 848-853.

[8]Maškov, V., Barilla, J., Simr, P., Bičánek, J. Modeling and simulation of coalition formation. In Proceedings of 5th International Conference on Simulation and Modeling Methodologies, Technologies and Applications, SIMULTECH-2015. Setúbal : SCITEPRESS – Science and Technology Publications, 2015, s. 8.

[9]Morávková, L., Tronsoco, J., Škvorová, M., Havlica, J., Petrus, P., Sedláková, Z. Volumetric behavior of the ternary system (methyl tert-butyl ether methylbenzene butan-1-ol) and its binary sub-system (methyl tert-butyl ether butan-1-ol) within the temperature range (298.15 to 328.15) K. The Journal of Chemical Thermodynamics, 2015, roč. 90, č. June 2015, s. 59-70.

[10]Moučka, F., Nezbeda, I., Smith, WR. Chemical potentials, activity coefficients, and solubility in aqueous NaCl solutions: Prediction by polarizable force fields. Journal of Chemical Theory and Computation, 2015, roč. 11, č. 4, s. 1756-1764.

[11]Nezbeda, I., Jirsák, J., Moučka, F., Smith, WR. Application of molecular simulations: Insight into liquid bridging and jetting phenomena. Condensed Matter Physics, 2015, roč. 18, č. 1, s. 13602-13612.

[12]Schraml, J., Korec, S., Krump, M., Čermák, J. Acetone-induced polymerization of 3-aminopropyltrimethoxysilane (APTMS) as revealed by NMR spectroscopy – revisited. Magnetic Resonance in Chemistry, 2015, roč. 53, č. 2, s. 154-159.

[13]Smith, W., Moučka, F., Nezbeda, I. Osmotic pressure of aqueous electrolyte solutions via molecular simulations of chemical potentials: Application to NaCl. Fluid Phase Equilibria, 2015, roč. 407, č. March 04, 2015, s. 76-83.

[14]Strašák, T., červenková, L., Bílková, V., Skoupá, V., Karban, J., Cuřínová, P., Čermák, J. Synthesis and fluorophilicity of compounds with tris(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)silyl substituent. Journal of Fluorine Chemistry, 2015, roč. 2015, č. 178, s. 23-29.

[15]Trokhymchuk, A., Melnyk, R., Nezbeda, I. Virial expansions and augmented van der Waals approach: Application to Lennard-Jones-like Yukawa fluid. Condensed Matter Physics, 2015, roč. 18, č. 1, s. 13501-12.

[16]Vlček, L., Uhlík, F., Moučka, F., Nezbeda, I., Chialvo, A. Thermodynamics of Small Alkali Metal Halide Cluster Ions: Comparison of Classical Molecular Simulations with Experiment and Quantum Chemistry. Journal of physical chemistry. A, Molecules, spectroscopy, kinetics, environment, & general theory, 2015, roč. 119, č. 3, s. 488-500.

2014

[1]Bobek, J., Straková, E., Ziková, A., Vohrádský, J. Changes in activity of metabolic and regulatory pathways during germination of S. coelicolor.. BMC Genomics, 2014, roč. 2014, č. 15, s. 1173-1188.

[2]Figueroa-Gerstenmaier, S., Lísal, M., Nezbeda, I., Smith, WR., Trejos, VM. Prediction of isoenthalps, Joule-Thomson Coeffcients and Joule-Thomson inversion curves of refrigerants by molecular simulation. Fluid Phase Equilibria, 2014, roč. 375, č. AUG 15 2014, s. 143-151.

[3]Jirsák, J., Moučka, F., Nezbeda, I. Insight into Electrospinning via Molecular Simulations. Industrial and Engineering Chemistry Research, 2014, roč. 53, č. 19, s. 8257-8264.

[4]Jirsák, J., Škvor, J., Nezbeda, I. Toward a simple molecular theory of hydrophobic hydration. Journal of Molecular Liquids, 2014, roč. 189, č. SI, s. 13-19.

[5]Lorecchio, C., Venanzi, M., Mazzuca, C., Lettieri, R., Palleschi, A., Nguyen, T., Cardová, L., Drašar, P., Monti, D. Tuning the chiroptical and morphological properties of steroidal-porphyrin aggregates: a mechanistic, structural, and MM investigation. Organic & Biomolecular Chemistry, 2014, roč. 12, č. 23, s. 3956-63.

[6]Smith, WR., Figueroa-Gerstenmaier, S., Škvorová, M. Molecular simulation for thermodynamic properties and process modeling of refrigerants. Journal of Chemical and Engineering Data, 2014, roč. 59, č. 10, s. 3258-3271.

[7]Strašák, T., Čermák, J., Červenková Šťastná, L., Sýkora, J., Fajgar, R. Cobalt(I) and cobalt(III) cyclopentadienyl complexes with new silicon-branched fluorous tags. Journal of Fluorine Chemistry, 2014, roč. 159, č. MAR 2014, s. 15-20.

[8]Strašák, T., Jaroschik, F., Malý, M., Čermák, J., Sýkora, J., Fajgar, R., Karban, J., Harakat, D. Titanocene dichloride complexes bonded to carbosilane dendrimers via a spacer of variable length – Molecular dynamics calculations and catalysis of allylic coupling reactions. Inorganica chimica acta, 2014, roč. 409, č. SI Part A, s. 137-146.

[9]Škvorová, M., Smith, WR. Molecular-level simulation of bubble and dew points of fluid mixtures and application to refrigerant cycle design. International Journal of Refrigeration – Revue internationale du Froid, 2014, roč. 42, č. JUN 2014, s. 1-7.

[10]Šmídl, M. Analýza prekonceptů strukturních vzorců sacharidů u žáků středních škol.. In Chemické listy.. Praha : Česká společnost chemická, 2014, s. 1.

2013

[1]Houšková, H., Morávková, L., Sedláková, Z., Boublík, T., Kolská, Z. Volumetric behavior of the ternary system benzene-2-methoxy-2-methylbutane-2,2,4-trimethylpentane and all binary sub-systems at temperature range (298.15-318.15) K. Fluid Phase Equilibria, 2013, roč. 337, č. JAN 15 2013, s. 156-164.

[2]Jirsák, J., Škvor, J., Nezbeda, I. Toward a simple molecular theory of hydrophobic hydration. Journal of Molecular Liquids, 2014, roč. 189, č. SI, s. 13-19.

[3]Komlóová, M., Horová, A., Hrabinová, M., Jun, D., Doležal, M., Vinšová, J., Kuča, K., Musílek, K. Preparation, in vitro evaluation and molecular modelling of pyridinium-quinolinium/isoquinolinium non-symmetrical bisquaternary cholinesterase inhibitors. Bioorganic and medicinal chemistry letters, 2013, roč. 23, č. 24, s. 6663-6666.

[4]Moučka, F., Nezbeda, I., Schmit, W. Computationally efficient Monte Carlo simulations for polarisable models: multi-particle move method for water and aqueous electrolytes. Molecular Simulation, 2013, roč. 39, č. 14-15, s. 1125-1134.

[5]Moučka, F., Nezbeda, I., Smith, WR. Molecular simulation of aqueous electrolytes: Water chemical potential results and Gibbs-Duhem equation consistency tests. Journal of Chemical Physics, 2013, roč. 139, č. 12, s. 1245051-7.

[6]Moučka, F., Nezbeda, I., Smith, W. Molecular Force Field Development for Aqueous Electrolytes: 1. Incorporating Appropriate Experimental Data and the Inadequacy of Simple Electrolyte Force Fields Based on Lennard-Jones and Point Charge Interactions with Lorentz-Berthelot Rules. Journal of Chemical Theory and Computation, 2013, roč. 9, č. 11, s. 5076-5085.

[7]Moučka, F., Nezbeda, I., Smith, WR. Molecular force fields for aqueous electrolytes: SPC/E-compatible chargedLJ sphere models and their limitations. Journal of Chemical Physics, 2013, roč. 138, č. 15, s. 154102-154111.

[8]Moučka, F., Nezbeda, I. Gibbs ensemble simulation on polarizable models: Vapor-liquid equilibrium in Baranyai-Kiss models of water. Fluid Phase Equilibria, 2013, roč. 360, č. 25 December 2013, s. 472-476.

[9]Nezbeda, I., Rouha, M. Extended excluded volume: Its origin and consequences. Pure and Applied Chemistry, 2013, roč. 85, č. 1, s. 201-210.

[10]Nezbeda, I., Jirsák, J. Water and aqueous solutions: simple non-speculative model approach. Physical Chemistry Chemical Physics, 2011, roč. 44, č. 13, s. 19689-19703.

[11]Nezbeda, I., Škvor, J. Excluded volume versus hydrogen bonding: complementary or incompatible concepts?. Molecular Physics, 2012, roč. 110, č. 24, s. 2987-2992.

[12]Strašák, T., Jaroschik, F., Malý, M., Čermák, J., Sýkora, J., Fajgar, R., Karban, J., Harakat, D. Titanocene dichloride complexes bonded to carbosilane dendrimers via a spacer of variable length – Molecular dynamics calculations and catalysis of allylic coupling reactions. Inorganica chimica acta, 2014, roč. 409, č. SI Part A, s. 137-146.

[13]Šmídl, M. Analýza obtížnosti tematického celku sacharidy a jejich metabolismus v učebnicích chemie pro gymnázia. In Metodologické otázky výzkumu v didaktice chemie. Brno : Masarykova Univerzita, Pedagogická fakulta, 2012, s. 8.

2012

[1]Berend, S., Vrdoljak, AL., Musílek, K., Kuča, K., Radič, B. Effects of Oxime K203 and Oxidative Stress in Plasma of Tabun Poisoned Rats. Croatica Chemica Acta, 2012, roč. 85, č. 2, s. 193-199.

[2]Boublík, T. Structure of two-dimensional hard disk systems. Simple geometric method. Fluid Phase Equilibria, 2012, roč. 316, č. 1, s. 1-5.

[3]Krejčí, J., Nezbeda, I. The critical temperature and properties of real gas from low order perturbed virial expansions. Fluid Phase Equilibria, 2012, roč. 314, č. 1, s. 156-160.

[4]Nezbeda, I., Škvor, J. Excluded volume versus hydrogen bonding: complementary or incompatible concepts?. Molecular Physics, 2012, roč. 110, č. 24, s. 2987-2992.

[5]Nguyen, T., Cardová, B., Dvořáková, M., Ročková, D., Drašar, P. Synthesis of cholic acid based calixpyrroles and porphyrins. Steroids, 2012, roč. 77, č. 8-9, s. 858-863.

[6]Šafránková, R. Experimentální zájmová činnost – motivace v chemickém vzdělávání. In Metodologické otázky výzkumu v didaktice chemie. Brno : Masarykova univerzita, 2012, s. 6.

[7] Šafránková, R. Rozvíjení zájmů a nadání dítěte v chemické zájmové činnosti. Praha : Univerzita Karlova v Praze, Pedagogická fakulta, 2012.

[8]Škvor, J., Nezbeda, I. Percolation line, response functions, and Voronoi polyhedra analysis in supercritical water. Condensed Matter Physics, 2012, roč. 15, č. 2, s. 23301-23308.

[9]Šmídl, M. Analýza obtížnosti tematického celku sacharidy a jejich metabolismus v učebnicích chemie pro gymnázia. In Metodologické otázky výzkumu v didaktice chemie. Brno : Masarykova Univerzita, Pedagogická fakulta, 2012, s. 8.