Ph.D. program: Syntéza a výroba léčiv, VŠCHT Praha
Téma práce: Příprava a charakterizace nových krystalových forem účinných farmaceutických látek

Magisterský program: Syntéza a výroba léčiv, VŠCHT Praha
Téma práce: Příprava a charakterizace nových vícekomponentních forem chloridu trospia

Bakalářský program: Syntéza a výroba léčiv, VŠCHT Praha
Téma práce: RTG strukturní analýza ergometrinu-N-oxidu

Vyučované předměty:

• Organická chemie
• Organická chemie Nmgr.

Zaměstnání a odborné stáže:

5. 2021 – 2. 2024

Vědecký a vývojový pracovník, senior/ ORLEN UniCRE a.s., oddělení výzkumu, Litvínov

Podávání grantových žádostí (národní i evropské), řešení a řízení grantových projektů, nezávislí výzkum, psaní vědeckých článků, rešeršní činnost (patenty a vědecké publikace).

10. 2020 – 4. 2021

Vědecký a vývojový pracovník / Spolchemie a.s., anorganický vývoj, Ústí nad Labem

Vedení svěřeného vývojového projektu, literární a patentová rešerše.

4. 2019 – 9. 2020

Vědecký pracovník vývoje aktivních farmaceutických substancí / Zentiva k.s., vývoj pevné fáze, Praha

Vedení pevnofázové části vývojových projektů, vedení bakalářských a diplomových studentů a stážistů, troubleshooting vývojových projektů, řízení 3D tisku, psaní patentových přihlášek, literární a patentová rešerše.

9. 2017 – 3. 2019

Ph.D. cont. / Zentiva k.s., vývoj pevné fáze, Praha

Podílení se na vývojových projektech, samostatný výzkum, vedení bakalářských a diplomových studentů a stážistů, literární a patentová rešerše.

12. 2016 – 8. 2017

Odborná stáž / University of Zürich, Švýcarsko

Řešení projektu krystalizačních technik, konzultace bakalářských a diplomových studentů, literární rešerše, stipendium Swiss-European Mobility Programme.

9. 2015 – 11. 2016

Ph.D. cont. / Zentiva k.s., vývoj pevné fáze, Praha

Podílení se na vývojových projektech, samostatný výzkum, vedení bakalářských a diplomových studentů a stážistů, literární a patentová rešerše.

Účast na konferencích a letních školách:

• ERTC: Ask the Experts, Praha, ČR, 2022

• The 9th International Conference on Chemical Technology, Mikulov, ČR, 2022, Prezentace posteru; Preparation of bioethylene and biopropylene from waste fat and rapeseed oil

• The 10Th Crystal Forms @ Bologna, Boloňa, Itálie, 2019

• The 31st European Crystallographic Meeting, Oviedo, Španělsko, 2018, Přednáška; Novel Screening Method for the Crystallization of Salts of Organic Cations

• The 7th International Conference on Chemical Technology, Mikulov, ČR, 2018, Přednáška; High-throughput Salt Screening of Active Pharmaceutical Compounds

• The 30th European Crystallographic Meeting, Basilej, Švýcarsko, 2016, Prezentace posteru; Structural Characterization of Various Salts of Trospium

2016 5. Mezinárodní škola krystalizace, Granada, Španělsko (5th International school of crystallization, Granada, Spain)
2016 3. Evropská krystalografická škola, Bol, Chorvatsko (3rd European crystallography school, Bol, Croatia)
2015 28. Ad hoc workshop Jana2006, Praha, Česká republika

2024 – 2028 Výzkum nových pokročilých metod výroby účinných farmaceutických látek (API) pro jejich efektivní a ekonomickou výrobu. Podpořený ve výzvě č. 02_23_020 Mezisektorová spolupráce OPJAK.

2023 – 2024 CK04000143, Výroba pokročilých biopaliv zpracováním Fischer Tropschových vosků. Podpořený výzvou DOPRAVA 2030 TaČR. Klíčový pracovník.

2023 – 2024 Accelerating the sustainable production of advanced biofuels and RFNBOs – from feedstock to end-use (FUELPHORIA). Podpořený z programu HORIZON (HORIZON-CL5-2022-D3-02): 101118286.

2019 – 2020 19-11027S, Betonárenský kal – nebezpečný odpad nebo druhotná surovina? Podpořený GAČR.

2019 – 2020 TJ02000256, Zlepšování vlastností léčiv pomocí pokročilých multikomponentních forem léčivých látek. Podpořený z programu ZETA 2 TaČR.

2019 – 2020 17-08389S, Pokročilá příprava katalyticky aktivních oxidů na kovových nosičích s využitím plazmové depozice a chemických metod. Podpořený GAČR.

2016 – 2019 16-10035S; Příprava farmaceutických kokrystalů a určování jejich krystalové struktury kombinací monokrystalové elektronové a RTG práškové difrakce. Podpořený GAČR.

2018 A2_FCHT_2018_012; Modifikace vysoce výkonných screeningových metod pro screening kokrystalů levetiracetamu a propyphenazonu. Podpořený VŠCHT-IGA. Hlavní řešitel.

2016 A2_FCHT_2016_008; Příprava a charakterizace nových solí trospia a studium jejich kokrystalizačního a solvatačního potenciálu. Podpořený VŠCHT-IGA. Hlavní řešitel.

Seznam publikací:

• Frątczak, J.; Górska, J.; Babor, M.; Gholami, Z.; Hidalgo Herrador, J.M. & de Paz Carmona, H. Production of Transportation Fuels from Fischer–Tropsch Waxes: Distillation, Blending, and Hydrocracking. Appl. Sci. 2024, 14, 4656. https://doi.org/10.3390/app14114656.
• Babor, M., Tišler, Z., Matějíčková, R., Peroutková, K., & Hidalgo Herrador, J. M. Liquefaction of Waste Rendering Fat Using Iron‐Containing Catalysts. Chemical Engineering & Technology, 2023, 46(6), pp. 1089–1097. https://doi.org/10.1002/ceat.202200516.
• Tichotová, M., Landovský, T., Lang, J., Jeziorowski, S., Schmidts, V., Kohout, M., Babor, M., Lhoták, P., Thiele, C. M., & Dvořáková, H. Enantiodiscrimination of Inherently Chiral Thiacalixarenes by Residual Dipolar Couplings. The Journal of Organic Chemistry, 2023. https://doi.org/10.1021/acs.joc.2c02594.
• Babor, M.; Tišler, Z.; Kocík, J.; Hubáček, J.; Bačiak, M. & Herrador, J. M. H. Bioethylene and biopropylene production from waste fat and rapeseed oil via catalytic hydrodeoxygenation and hydrocracking followed by pyrolysis. Chemical Engineering & Technology, 2022, 45: 2071-2079. https://doi.org/10.1002/ceat.202200256.
• Skořepová, E.; Vaclavik, M.; Jirat, J.; Poupon, M.; Ridvan, L.; Babor, M. & Soos, M. Obeticholic Acid Forms Two Series of Isostructural Non-stoichiometric Channel Solvates. Crystal Growth & Design, 2022, 22(9), 5589-5597. https://doi.org/10.1021/acs.cgd.2c00688
• Herrador, J. M. H.; Babor, M.; Brablíková, M.; Moghaddam, M. A. & Vráblík, A. Industrial sewage sludge direct liquefaction co-processing with tetralin or light cycle oil. Molecular Catalysis, 2022, 532, 112697. https://doi.org/10.1016/j.mcat.2022.112697.
• Jirát, J.; Babor, M.; Ridvan, L.; Skořepová, E.; Dušek, M.; & Šooš, M. Structure–property relations of a unique and systematic dataset of 19 isostructural multicomponent apremilast forms. IUCrJ, 2022, 9(4). https://doi.org/10.1107/S2052252522005577.
• Jurásek, B.; Rimpelová, S.; Babor, M.; Čejka, J.; Bartůněk, V. & Kuchař, M. Intriguing Cytotoxicity of the Street Dissociative Anesthetic Methoxphenidine: Unexpected Impurities Spotted. Int. J. Mol. Sci., 2022, 23, 2083. https://doi.org/10.3390/ijms23042083.
• Hidalgo Herrador, J. M.; Babor, M.; Tomar, R.; Tišler, Z.; Hubáček, J.; de Paz Carmona, H.; Frątczak J.; Vráblík A. & Ángeles, G. H. Polypropylene and rendering fat degrading to value-added chemicals by direct liquefaction and fast-pyrolysis. Biomass Conversion and Biorefinery, 2022, 1-10. https://doi.org/10.1007/s13399-022-02405-4.
• Landovský, T.; Babor, M.; Čejka, J.; Eigner, V.; Dvořáková, H.; Krupička, M. & Lhoták, P. Nucleophile-Induced Transformation of Phenoxathiin-Based Thiacalixarenes. Org. Biomol. Chem., 2021, 19, 8075-8085, https://doi.org/10.1039/D1OB01487K.
• Tobrman, T.; Krupička, M.; Polák, P.; Dvořáková, H.; Čubiňák, M.; Babor, M.; Dvořák, D. Diastereoselective Cyclopropanation through Michael Addition-Initiated Ring Closure between α,α-Dibromoketones and α,β-Unsaturated Fischer Carbene Complexes: Diastereoselective Cyclopropanation through Michael Addition-Initiated Ring Closure between α,α-Dibromoketones and α,β-Unsaturated Fischer Carbene Com. Eur. J. Org. Chem. 2020, 2020 (4), 429–436. https://doi.org/10.1002/ejoc.201901503.
• Jirát, J.; Zvoníček, V.; Babor, M.; Ridvan, L.; Skořepová, E.; Dušek, M.; Šoóš, M. Formation of the First Non-Isostructural Cocrystal of Apremilast Explained. Cryst. Growth Des. 2020, 20 (9), 5785–5795. https://doi.org/10.1021/acs.cgd.0c00393.
• Landovský, T.; Eigner, V.; Babor, M.; Tichotová, M.; Dvořáková, H.; Lhoták, P. Regioselective S N Ar Reaction of the Phenoxathiin-Based Thiacalixarene as a Route to a Novel Macrocyclic Skeleton. Chem. Commun. 2020, 56 (1), 78–81. https://doi.org/10.1039/C9CC08335A.
• Babor, M.; Nievergelt, P. P.; Čejka, J.; Zvoníček, V.; Spingler, B. Microbatch Under-Oil Salt Screening of Organic Cations: Single-Crystal Growth of Active Pharmaceutical Ingredients. IUCrJ 2019, 6 (1), 145–151. https://doi.org/10.1107/S2052252518017876.
• März, M.; Babor, M.; Cibulka, R. Flavin Catalysis Employing an N(5)-Adduct: An Application in the Aerobic Organocatalytic Mitsunobu Reaction: Flavin Catalysis Employing an N(5)-Adduct: An Application in the Aerobic Organocatalytic Mitsunobu Reaction. Eur. J. Org. Chem. 2019, 2019 (20), 3264–3268. https://doi.org/10.1002/ejoc.201900397.
• Brázda, P.; Palatinus, L.; Babor, M. Electron Diffraction Determines Molecular Absolute Configuration in a Pharmaceutical Nanocrystal. Science 2019, 364 (6441), 667–669. https://doi.org/10.1126/science.aaw2560.
• Jirát, J.; Ondo, D.; Babor, M.; Ridvan, L.; Šoóš, M. Complex Methodology for Rational Design of Apremilast-Benzoic Acid Co-Crystallization Process. Int. J. Pharm. 2019, 570, 118639. https://doi.org/10.1016/j.ijpharm.2019.118639.
• Tlustý, M.; Eigner, V.; Babor, M.; Kohout, M.; Lhoták, P. Synthesis of Upper Rim-Double-Bridged Calix[4]Arenes Bearing Seven Membered Rings and Related Compounds. RSC Adv. 2019, 9 (38), 22017–22030. https://doi.org/10.1039/C9RA05075B.
• Tlustý, M.; Spálovská, D.; Babor, M.; Lhoták, P. Synthesis of Enantiomerically Pure Inherently Chiral Calix[4]Arenes Using the Meta-Substitution Strategy. Tetrahedron Lett. 2019, 60 (3), 260–263. https://doi.org/10.1016/j.tetlet.2018.12.026.
• Váňová, H.; Tobrman, T.; Babor, M.; Dvořák, D. Reaction of Lithiated Thiophene-Derived Aminocarbene Complexes with Inorganic Halides: Preparation of a Heteroatom Containing Mono- and Multicarbene Complexes. J. Organomet. Chem. 2019, 882, 90–95. https://doi.org/10.1016/j.jorganchem.2018.12.015.
• Kortus, D.; Mikšátko, J.; Kundrát, O.; Babor, M.; Eigner, V.; Dvořáková, H.; Lhoták, P. Chemistry of 2,14-Dithiacalix[4]Arene: Alkylation and Conformational Behavior of Peralkylated Products. J. Org. Chem. 2019, 84 (18), 11572–11580. https://doi.org/10.1021/acs.joc.9b01493.
• Jurásek, B.; Babor, M.; Huber, S.; Kuchař, M. X-Ray Powder Diffraction Data for Methoxmetamine Hydrochloride, C 14 H 20 ClNO 2. Powder Diffr. 2018, 33 (3), 242–245. https://doi.org/10.1017/S0885715618000532.
• Landovský, T.; Dvořáková, H.; Eigner, V.; Babor, M.; Krupička, M.; Kohout, M.; Lhoták, P. Chemoselective Oxidation of Phenoxathiin-Based Thiacalix[4]Arene and the Stereoselective Alkylation of Products. New J. Chem. 2018, 42 (24), 20074–20086. https://doi.org/10.1039/C8NJ04690E.
• Nievergelt, P. P.; Babor, M.; Čejka, J.; Spingler, B. A High Throughput Screening Method for the Nano-Crystallization of Salts of Organic Cations. Chem. Sci. 2018, 9 (15), 3716–3722. https://doi.org/10.1039/C8SC00783G.
• Maixner, J.; Jurásek, B.; Himl, M.; Kuchař, M.; Babor, M. X-Ray Powder Diffraction Data for Methoxetamine Hydrochloride, C 15 H 22 ClNO 2. Powder Diffr. 2017, 32 (4), 265–267. https://doi.org/10.1017/S0885715617000860.
• Zvoníček, V.; Skořepová, E.; Dušek, M.; Babor, M.; Žvátora, P.; Šoóš, M. First Crystal Structures of Pharmaceutical Ibrutinib: Systematic Solvate Screening and Characterization. Cryst. Growth Des. 2017, 17 (6), 3116–3127. https://doi.org/10.1021/acs.cgd.7b00047.
• Rohlíček, J.; Skořepová, E.; Babor, M.; Čejka, J. CrystalCMP : An Easy-to-Use Tool for Fast Comparison of Molecular Packing. J. Appl. Crystallogr. 2016, 49 (6), 2172–2183. https://doi.org/10.1107/S1600576716016058.

Patenty a užitné vzory:

• Pevné formy bictegraviru s anorganickými bázemi, CZ 2019-358

• Pevné formy selektivního JAK-1 inhibitoru, CZ 2019-37062

• Vanad-wolframový katalyzátor na bázi oxidu titaničitého pro hydrodeoxygenaci a hydrokrakování přírodních olejů a lipidů, CZ 2022-39624

• Katalyzátor na bázi železa na alkalicky aktivované zeolitové pěně pro deesterifikaci a deoxygenaci přírodních lipidů, CZ 2022-40031

• Pt/y-AI2O3 katalyzátor na bázi aluminy pro hydrokrakování těžkých vosků získaných Fischer-Tropschovou syntézou, CZ 2023-41480

Hodnocení grantových přihlášek:

• TaČR: hodnocení návrhů projektů – 6

• TaČR: hodnocení projektů – 2

• MŠMT: hodnocení návrhů mezinárodních projektů – 7